home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00307 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  29 lines
  1. *****************************
  2. * HMG14 and HMG17 signature *
  3. *****************************
  4.  
  5. High mobility group (HMG) proteins  are a  family of  relatively low molecular
  6. weight non-histone components in chromatin.  HMG14 and  HMG17 [1], two related
  7. proteins of about  100  amino  acid residues,  bind  to  the inner side of the
  8. nucleosomal DNA thus altering the interaction between the DNA and  the histone
  9. octamer. These two proteins may  be  involved  in  the process which maintains
  10. transcribable genes in a unique chromatin conformation.
  11.  
  12. The trout nonhistone chromosomal  protein H6 (histone T)  also belongs to this
  13. family.
  14.  
  15. As a signature pattern we selected a  conserved stretch of 10 residues located
  16. in the N-terminal section of HMG14 and HMG17.
  17.  
  18. -Consensus pattern: R-R-S-A-R-L-S-A-[RK]-P
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21.  
  22. -Expert(s) to contact by email: Landsman D.
  23.                                 landsman@ncbi.nlm.nih.gov
  24.  
  25. -Last update: May 1991 / Text revised.
  26.  
  27. [ 1] Bustin M., Lehn D.A., Landsman D.
  28.      Biochim. Biophys. Acta 1049:231-243(1990).
  29.